Les phases de recrutement de CARTaGENE couvrent la population des hommes et des femmes âgés de 40 à 69 ans et vivant à Montréal, Québec, Sherbrooke ou Saguenay (Phase A) et Gatineau, Montréal, Trois-Rivières, Sherbrooke, Québec et Saguenay (Phase B). Au total, 43 000 Québécoises et Québécois ont été recrutés.